JSFはXHTMLだからスクリプトレットのコメントみたいなのが使えないわけです。
なのでコメントかいておくとリリースしても見えちゃって嫌だなっておもっていたら設定がありました。
<context-param> <param-name>facelets.SKIP_COMMENTS</param-name> <param-value>true</param-value> </context-param>
これで一切のコメントが出力されなくなります。
また同時にEL式もコメントを優先してくれるようになります。